В модели используются как линейный режим, так и режим рефлектрона. Масс-спектрометр AXIMA Confidence снабжен специальными пакетами программного обеспечения для автоматизации экспериментов в протеомике, анализе олигонуклеотидов/праймеров, ВЭЖХ-МАЛДИ, исследовании полимеров, гистологическом картировании, скрининге биомаркеров, лекарственных соединений и их метаболитов. Гибкая производительная система с интуитивным управлением для аналитических и биотехнологических лабораторий обеспечивает максимум результативности при минимальном вводе данных.